ES paramos projektai rengiami ir vykdomi vadovaujantis ir bendradarbiaujant su:
Investicijų ir verslo garantijos
Transporto investicijų direkcija
Nacionalinė mokėjimo agentūra
Aplinkos projektų valdymo agentūra
Lietuvos verslo paramos agentūra
Centrinė projektų valdymo agentūra
Europos socialinio fondo agentūra
Mokslo, inovacijų ir technologijų agentūra- Aplinkos projektų valdymo agentūra
- Mokslo, inovacijų ir technologijų agentūra
- Investicijų ir verslo garantijos
- Transporto investicijų direkcija
- Centrinė projektų valdymo agentūra
- Lietuvos verslo paramos agentūra
- Nacionalinė mokėjimo agentūra
- Europos socialinio fondo agentūra